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Resumen

La Dra. M. Fernanda Mendoza obtiene su grado de Licenciatura en Química y título profesional de Química en la Universidad de Concepción (2012). En el mismo año se adjudica una beca de postgrado (programa Becas Chile), realizando un Máster en Química Teórica y Computacional (2012-2013) y un Doctorado en Química en el Instituto de Biotecnología y Biomedicina de la Universidad Autónoma de Barcelona (2013-2016). Entre 2017-2022 realiza docencia en la Universidad Andrés Bello-sede Concepción, impartiendo cursos de Química General, Química Orgánica y Fisicoquímica para diversas carreras del área de la salud y la ingeniería. Paralelamente, se desempeña como investigadora responsable del proyecto Fondecyt de Postdoctorado Nº 3180146 (2018-2021) en la misma casa de estudios.

La investigación de la Dra. Mendoza se enfoca en la simulación computacional de procesos bioquímicos y biocatalíticos a un nivel de detalle atómico-electrónico. Su objetivo es modelar los mecanismos moleculares que subyacen las interacciones proteína-ligando y reacciones enzimáticas, contribuyendo así al diseño más eficiente de enzimas y drogas.

Actualmente, la Dra. Mendoza es profesora asistente del Departamento de Ciencias Químicas y Recursos Naturales de la Universidad de la Frontera.

PUBLICACIONES

Leslie Sánchez, Fabiola E. Medina, Fernanda Mendoza, Camilo Febres y Gonzalo A. Jaña. Elucidation of the reaction mechanism of Cavia porcellus L-Asparaginase (CpA): A QM/MM study. Bajo revisión.

Fernanda Mendoza y Gonzalo A. Jaña*. The Inverting Mechanism of the Metal Ion-Independent LanGT2: The First Step to Understand the Glycosylation of Natural Product Antibiotic Precursors Through QM/MM Simulations. Organic & Biomolecular Chemistry, 19, 5888-5898, 2021. DOI: doi.org/10.1039/D1OB00544H

Fernanda Mendoza y Laura Masgrau. Computational Modelling of Carbohydrate Processing Enzymes Reactions. Current Opinion in Chemical Biology, 61, 203-213, 2021.

Fernanda Mendoza y Gonzalo A. Jaña. Unveiling the Dynamical and Structural Features That Determine the Orientation of the Acceptor Substrate in the Landomycin Glycosyltransferase LanGT2 and Its Variant with C-Glycosylation Activity. Journal of Chemical Information and Modeling, 60, 933-943, 2020. DOI: doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00865.

Fernanda Mendoza, Fabiola E. Medina, Verónica A. Jiménez y Gonzalo A. Jaña. The Catalytic Role of Gln202 in the Carboligation Reaction Mechanism of Yeast AHAS: A QM/MM Study. Journal of Chemical Information and Modeling, 60, 915-922, 2020. DOI: doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00863.

Leslie Sánchez, Fernanda Mendoza, Joel B. Alderete, Verónica A. Jiménez y Gonzalo A. Jaña. The Role of Conserved Arginine in GH70 family: A Computational Study on the Structural Features and its Implications on the Catalytic Mechanism of GTF-SI from Streptoccocus mutans. Organic & Biomolecular Chemistry, 17, 6269-6276, 2019. DOI: doi.org/10.1039/C9OB01055F.

Victor A. Streltsov, Sukanya Luang, Alys Peisley, Joseph N. Varghese, James R. Ketudat Cairns, Sebastien Fort, Marcel Hijnen, Igor Tvaroška, Ana Ardá, Jesús Jiménez-Barbero, Mercedes Alfonso-Prieto, Carme Rovira, Fernanda Mendoza, Laura Tiessler-Sala, José-Emilio Sánchez-Aparicio, Jaime Rodríguez-Guerra, José M. Lluch, Jean-Didier Maréchal, Laura Masgrau y Maria Hrmova. Discovery of Processive Catalysis by an Exo-Hydrolase with a Pocket Shaped Active Site. Nature Communications, 10, 2222, 2019. DOI: doi.org/10.1038/s41467-019-09691-z.

Manuel I. Osorio, Matías A. Zuñiga, Fernanda Mendoza, Gonzalo A. Jaña y Verónica A. Jiménez. Modulation of Glucan-Enzyme Interactions by Domain V in GTF-SI from Streptococcus Mutans. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 87, 74-80, 2019. DOI: 10.1002/prot.25624.

Gonzalo A. Jaña, Fernanda Mendoza, Manuel I. Osorio, Joel B. Alderete, Pedro A. Fernandes, María J. Ramos y Verónica A. Jiménez. A QM/MM Approach on the Structural and Stereoelectronic Factors Governing Glycosylation by GTF-SI from Streptococcus mutans. Organic & Biomolecular Chemistry, 16, 2438-2447, 2018. DOI: doi.org/10.1039/C8OB00284C.

Fernanda Mendoza, José M. Lluch y Laura Masgrau. Computational Insights into Active Site Shaping for Substrate Specificity and Reaction Regioselectivity in the EXTL2 Retaining Glycosyltransferase. Organic & Biomolecular Chemistry, 15, 9021-9244, 2017. DOI: doi.org/10.1039/C7OB01937H.

Fernanda Mendoza, Hansel Gómez, José M. Lluch y Laura Masgrau. α1,4‐N‐Acetylhexosaminyltransferase EXTL2: The Missing Link for Understanding Glycosidic Bond Biosynthesis with Retention of Configuration. ACS Catalysis, 6, 2577-2589, 2016. DOI: doi.org/10.1021/acscatal.5b02945.

David Albesa-Jové, Fernanda Mendoza, Ane Rodrigo-Unzueta, Fernando Gomollýn-Bel, Javier O. Cifuente, Saioa Urresti, Natalia Comino, Hansel Gómez, Javier Romero-García, José M. Lluch, Enea Sancho-Vaello, Xevi Biarnés, Antoni Planas, Pedro Merino, Laura Masgrau, and Marcelo E. Guerin. Native Ternary Complex Trapped in a Crystal Reveals the Catalytic Mechanism of a Retaining Glycosyltransferase. Angewandte Chemie International Edition, 54, 9898-9902, 2015. DOI: doi.org/10.1002/anie.201504617.

Hansel Gómez, Fernanda Mendoza, José M. Lluch y Laura Masgrau. QM/MM Studies Reveal How Substrate–Substrate and Enzyme–Substrate Interactions Modulate Retaining Glycosyltransferase Catalysis and Mechanism. Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, 100, 225-254, 2015. DOI: 10.1016/bs.apcsb.2015.06.004.

PROTECTOS DE INVESTIGACIÓN

(2018-2021) Proyecto Fondecyt de Postdoctorado Nº 3180146: Unveiling the Factors that Determine the Enzymatic C-glycosidic Bond Formation: A QM/MM Approach. Investigadora Responsable.

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